Служебно-боевая и общественно-государственная подготовка с личным составом академии проводится в соответствии с требованиями приказов Минюста России от 27 августа 2012 г. № 169 «Об утверждении Наставления
по организации профессиональной подготовки сотрудников уголовно-исполнительной системы», от 26 февраля 2006 г. № 24 «Об утверждении Курса стрельб из стрелкового оружия для сотрудников уголовно-исполнительной системы», от 12 ноября 2001 г. № 301 «Об утверждении Наставления по физической подготовке сотрудников уголовно-исполнительной системы России», и ежегодных приказов Академии ФСИН России «Об организации занятий по служебно-боевой и общественно-государственной подготовке с личным составом Академии ФСИН России».
Занятия по служебно-боевой и общественно-государственной подготовке с личным составом Академии ФСИН России проводятся в течение календарного года. Приказом по академии перед календарным годом утверждаются учебные планы занятий по служебно-боевой и общественно-государственной подготовке, тематические планы занятий, состав учебных группы, графики проведения занятий и сдачи контрольных нормативов по физической и огневой подготовкам.
В структуру служебной подготовки входят:
Организацию занятий и контроль над их проведением обеспечивает отдел по работе с личным составом. Для более эффективного проведения занятий личный состав вуза разделен на учебные группы и подгруппы по спецификации и направлению деятельности. Руководство и организацию занятий по специальной подготовки осуществляют руководители учебных групп.
Общее руководство и организацию служебно-боевой подготовки осуществляет заместитель начальника академии по работе с личным составом полковник внутренней службы Анкудинов Н.В.